Ähnlichkeitsmatrix

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Eine Ähnlichkeitsmatrix ist eine Matrix von Einzelwerten, die die Ähnlichkeit zwischen zwei mehrdimensionalen Datenpunkten ausdrückt.

Verwendung in der Bioinformatik

Ähnlichkeitsmatrizen (PAM, BLOSUM) spielen eine wichtige Rolle beim Sequenzalignment. Ähnliche Nukleotide oder Aminosäuren erhalten höhere "Scores" als unähnliche, wobei die Ähnlichkeit hier durch die chemischen Eigenschaften der Bausteine und ihre Mutationsraten gleichermaßen definiert sind.

Siehe auch


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